是由于消防系统中的许多设备存在一些精密部件容易被污物堵塞，所以这些设备对水质特别是对水的浊度要求较高，如报警阀、喷头、减压阀等。目前，一般通过设置过滤器来保证喷淋、喷雾系统和减压阀的正常工作。
消防用水水质恶化，细菌滋生，藻类、苔藓类及浮游生物等大量繁殖，水的浊度提高，甚至在水中存在生物粘泥和较大的漂浮物，这可能会造成消防系统部分设备的堵塞；此外，由于火灾时大量消防用水需在短时间内进行过滤，水质恶化也会造成过滤器的堵塞。因此水质恶化将影响对火场的控制和对火灾的快速扑救。
消防水池、消防水箱内水的水质恶化常常伴随着水的变臭，臭味从气孔或人孔的缝隙向外散发，污染了周边空气环境。当消防水池设在高层建筑的地下室、高位水箱设在顶层的消防水箱间内时，由于地下室和水箱间内的通风效果较差，臭味很难向外散发，将会造成严重的室内空气污染。
此外，由于消防水池 / 水箱由于管理的原因三孔密封不严、防蚊网损坏等原因造成蚊子进入消防水池 / 水箱内产卵，消防水池 / 水箱成为蚊子的天然孳生地。
建筑物发生火灾时，消防系统发挥功能，建筑物内的人员不可避免的要与消防用水接触。由于消防用水水质恶化，细菌孳生，不可避免的也存在各种致病细菌，人体与这些含有大量细菌的消防用水接触后可能导致疾病，影响人员的身体健康。
虽然消防用水的主要功能是灭火，对水质的要求较低，但是从前面的讨论中可以看出，消防用水的水质恶化除了对周边环境、人体健康产生不利影响外，还会影响消防系统灭火功能的正常发挥，因此，有必要采取一定的措施保证消防水池 / 消防水箱内的水质。
所以我们需要采取一定的消毒措施来避免这种情况。一般我们建议采用水箱自洁消毒器，而不是
次氯酸钠发生器，为什么呢？
因为水箱自洁消毒器采用微电解原理，将水中的自有成分微电解为具有*消毒功能的氧化物质，主要包括次氯酸根等氯类物质和各种自由基等。水经过微电解后回流至水池 / 水箱对消防用水进行杀菌灭藻。此外，当水经过微电解器时，由于微电解器改变了藻类和细菌的环境电场，水中的藻类和细菌也能被有效杀灭。
这两种产品均不需向水中投加任何外源物质，管理简单，使用安全可靠，杀菌效果已被试验和大量工程实践所证明。而且能使水中保持一定的余氯，具有持续的杀菌和抑菌抑藻作用。
目前市场上的水箱自洁消毒器分为内置式和外置式两种。内置式的优点是不占地，安装简单，设计工作量小。缺点是检修维护不便，因此在水箱 / 水池设计时须考虑水箱自洁消毒器的检修维护问题。外置式的优点是检修维护方便，缺点是需占地 0.20m 2 ，需管道连接。有的外置式水箱消毒机(水箱自洁消毒器)还设有水力漩流分离器，能够有效去除水中的悬浮颗粒。
而通过定期投加消毒剂、设置二氧化氯发生器、次氯酸钠发生器等手段对消防用水进行消毒，这些措施工作量大，管理要求高，具有一定的危险性，从楼宇和小区的管理角度不是很适合。
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